10 June 2025

Een zwartbuikkoolmees: een superaantrekkelijk mannetje voor de vrouwtjes of een melanistische mutant?

Zwartbuik koolmees 27 mei 2025 (©GK)

Onlangs zag ik een heel bijzondere koolmees. Hij heeft een vrijwel geheel zwarte buik. Normaal hebben koolmees mannetjes een gele borst met een zwarte verticale streep op keel en borst. Het zwart in de foto komt niet door schaduwwerking. Het is echt een zwarte buik. Ter vergelijking: er is op de kop wit te zien en het bovenste deel van de borst is gelig. Ook de vleugel is donkerder dan normaal.


koolmeesman 2 juni 2025 (©GK)

Hier zijn nog 2 foto's van latere datum van vermoedelijk hetzelfde individu. Ik denk dat dit niet een willekeurige variate is, maar dat het verklaarbaar is. In wetenschappelijke publicaties kom je tegen dat vrouwtjes mannetjes met een brede borststreep prefereren [1],[2]. Ik kan me voorstellen dat door de onderliggende genetica van die zwarte borststreep er een keer een variant ontstaat waarbij de zwarte borststreep zich extreem heeft uitgebreid. Vrouwtjes zouden dat extra aantrekkelijk kunnen vinden. Daartegenover staat dat het contrast van een zwarte streep tegen een gele achtergrond helemaal wegvalt. 

Op de eerste foto is te zien dat de koolmees een rups in zijn snavel heeft, hij heeft dus een nest met jongen en dus een partner! Dat is gelukt!

Tot nu toe heb ik nog geen waarnemingen of literatuur gevonden over koolmezen met extreme zwarte borst.

 

Zo ziet een normale koolmees man er uit.
Foto: Marleen (waarneming.nl)

 


Literatuur

  1. Mate Choice in Double-Breeding Female Great Tits (Parus Major): Good Males or Compatible Males, 11 January 2021. "Double-breeding females prefer males with large breast stripes,..."
  2. The great tit abdominal stripe contains a sexually dichromatic colour patch hidden from the human eye. Deze publicatie gaat met name over de UV patronen die koolmezen zouden zien ('bird-visible'), maar laat ook verschil man-vrouw goed zien: vrouw links, man rechts ('human-visible').
  3.  

    Bron: publicatie [2]

  4. Dutch Birding: koolmees met zwarte kop (met dank aan Klaas van Dijk) 
  5. website strandloper.nl met Koolmees met melanisme (met dank aan Klaas van Dijk) 
  6. Melanistische Pimpelmees in Heuvelland (W) (natuurpunt.be) met uitgebreide toelichting. (met dank aan Klaas van Dijk) 
  7. Hein van Grouw (2006) Not every white bird is an albino: sense and nonsense about colour aberrations in birds. Dutch Birding 28: 79-89, 2006 (met dank aan Klaas van Dijk)



ObsIdentify

Het is altijd interessant hoe het beeldherkenningsprogramma ObsIdentify (waarneming.nl) afwijkende koolmezen en pimpelmezen identificeert. Wat zijn de essentiële kenmerken van deze soorten in de ogen van ObsIdentify? Hoeveel afwijking kan ObsIdentify verdragen voordat het helemaal fout gaat? Dit experiment geeft verrassende resultaten:

Koolmees 31%
Dutch Birding

Atlasvink 81% (!) Fringilla spodiogenys africana
zie ook foto beneden.  bron

Koolmees 59% bron

Koolmees 38% bron

 
Koolmees 100% (!) bron

Pimpelmees 72% bron

Pimpelmees 92% bron

Pimpelmees 82% bron


Fringilla spodiogenys africana. bron
(zie boven). Hierdoor wordt het begrijpelijk waarom ObsIdentify de fout maakte!
Deze soort lijkt een melanistische vorm van onze Europese vink!
Tegelijkertijd betekent het dat Obs. trainingsdata moet hebben gehad van niet-Europese vogels.




31 May 2025

Een sfeervolle avondwandeling met een zeer relaxte ree


 

Na een bewolkte en regenachtige dag met zo nu en dan hevige stortbuien, begint 's avonds de zon door te breken.  Dan spot ik een ree die zich van niemand iets lijkt aan te trekken.

Hij doet gewoon zijn ding. Hij is kennelijk gewend dat mensen hem niet dicht kunnen naderen vanwege een sloot. Het is een klein landgoed van het Utrechts Landschap en ligt ingeklemd tussen drukke wegen. Er wordt sowieso niet gejaagd en zijn er geen wolven. Het gebied is niet toegankelijk voor honden.  De rustige sfeer komt goed tot uiting in de zang van merels en andere vogels op de achtergrond. Iedereen, mens en dier, is blij met een uurtje zon na een regenachtige dag. Na een paar hapjes bladeren van de struiken verdwijnt het dier weer in het dichte struikgewas.

 

Technische gegevens

Deze video is ook een aardige demonstratie van het zoombereik van de Sony RX10-iv (een 24 - 600mm zoom bridgecamera). Opname 28 mei 2025.

25 May 2025

Een belediging voor Charles Darwin: deze bizarre larve van een lieveheersbeestje spot met de wetten van camouflage


Als het diertje een schutkleur had gehad, had ik hem zeker niet gezien! Het lijkt nog het meest meest op een kluwen witte wol met pootjes. Als hij niet gelopen had, zag je niet dat het überhaupt een dier was. En wat een zuivere witte kleur! Hoe kan dat een schutkleur zijn?! Een belediging voor Charles Darwin! Zijn ze misschien giftig voor vogels? Is het een waarschuwingskleur? Zijn ze oneetbaar door die stekels? Smaken die beestjes vies? De meeste larven van lieveheersbeestjes zien er totaal anders uit. En wat zijn dat voor uitsteeksels op zijn rug? Veertjes? Pluizen? Haren? Het blijft bizar! Het is een larve van een lieveheersbeestje. De precieze soort is niet vast te stellen. Op de pagina van de familie Lieveheersbeestjes staat geen foto van deze larve.

 

Bronnen

youtube (mijn filmpje)

waarneming.nl : Scymninae indet betekent niet vast te stellen soort van de subfamilie Scymninae. Waarneming.nl heeft een pagina Scymninae indet. waar wel een foto van het beestje staat. De Engelse Wikipedia pagina: Scymninae

De Onderfamilie SCYMNINAE worden ook wel Dwergkapoentjes !  genoemd (Nederlands soortenregister).

Familie lieveheersbeestjes (waarneming.nl)

BNNVARA maakte er in 2017 een pagina over met allerlei interessante wetenswaardigheden en een fraaie foto: Larve blijkt wolf in schaapskleren (ik ben het niet met alles eens!). Wist ik niet toen ik dit blog schreef.

Technische details: Sony A6400 90mm macrolens.

21 May 2025

Nocturnal visit of a Stone Marten - Nachtelijk bezoek van een Steenmarter (met update)


Dit dier is 's nachts door een wildcamera vastgelegd. Dit is een uitzonderlijke succes voor een wildcamera. Totaal onverwacht. Ik had van te voren geen enkele indicatie dat er op deze plek een hermelijn of steenmarter zou kunnen rondlopen. Ik had ook geen voer neergelegd behalve de vorige dag wat broodkruimels voor mussen en muizen, maar dat was al op. Het enige was een drinkbak met water. Maar daar heeft het dier niet van gedronken ondanks de wekenlange droogte. Het gaat om twee nacht opnames 15 en 16 mei achter elkaar gemonteerd. Mogelijk hetzelfde individu omdat het op dezelfde locatie is.

Volgens mij is dit een Hermelijn (Mustela erminea) en geen Steenmarter 100% (Martes foina) zoals ObsIdentify aangeeft. De staart met donkere pluim is niet van een Steenmarter.

Ik heb de waarneming in waarneming.nl ingevoerd en wacht op goedkeuring.

Update 22/23 mei: volgens de moderator JFK van waarneming.nl is dit een Steenmarter (Martes foina). Zijn uitleg is:

"Een hermelijn is een heel slanke, dun gebouwde marter. Qua bouw is het eigenlijk een soort dubbele muis. Bij een hermelijn is niet alleen de borst wit, maar ook de hele buik. De staart is kort en met een duidelijke zwarte punt. De steen- en boommarter zijn de twee grote marters in Nederland. Fors gebouwd en met een lange, pluizige staart. De twee zijn lastig uit elkaar te houden, maar dit is een steenmarter omdat het dier niet zo hoog op de poten staat als een boommarter, de oren vrij ver uit elkaar staan en de witte bef loopt door tot op de voorpoten (bij een boommarter niet). "

Ik heb de soortnaam daarom in Steenmarter gewijzigd. Heel passend meldt waarneming.nl bij Steenmarter:

"Tot voor kort golden steenmarters als nagenoeg uitsluitend nachtactief – zelfs in die mate dat dit als bruikbare indicatie voor het onderscheid tussen boom– en steenmarter kon gelden bij vluchtige veldwaarnemingen."

Conclusion: according to an expert (associated with observation.org) this is a Stone Marten (Martes foina), not a Stoat. 


Bronnen

youtube

waarneming.nl 

Steenmarter 

 

 

 

 

 

 

03 May 2025

Carnivore huismus! De natuur is wreed...Het is lente!


 

Een carnivore huismus! Wie had dat gedacht? We kennen de huismus als een gezellige, vredelievende, onschuldige zaadeter. Maar in het voorjaar verandert dit gezellig tjilpende beestje in een fanatieke carnivoor: hij verorbert meikevers zo veel als hij te pakken kan krijgen. 

De afgelopen 3 dagen heb ik een mannetje huismus al bezig gezien met 10 meikevers. Tot nu toe alleen mannetjes. En dat zijn alleen de keren dat ik het gezien heb. Het moeten er dus meer zijn. Dit mannetje is er kennelijk zeer bedreven in. Ik heb nog geen vrouwtje hetzelfde zien doen. Ik heb geen idee waar hij ze vandaan haalt. Ik zie ze niet in onze tuin vliegen.

Koploze meikever met 2 losse dekschilden, en twee vleugels

Van de teruggevonden kevers ontbreken kop, poten, dekschilden en vleugels. Misschien wordt de kop als eerste en enige opgegeten? Zo kan het beestje er immers niet meer van door gaan. Zou ik denken. Maar, ik heb ook een nog levend beestje gevonden waarvan alle pootjes er af waren en het met de stompjes die nog over waren zinloze loopbewegingen maakte. Een triest gezicht.

Ik zie wel dat er iets gegeten wordt. Maar het lijkt er op dat het middenstuk nooit wordt gegeten. Alleen de kop? De vleugels en dekschilden worden in ieder geval niet op gegeten, want die vind je terug. De poten heb ik niet teruggevonden. Die lijken me ook niet echt eetbaar. Worden die arme beestjes dan vooral als plezierig tijdverdrijf levend gedemonteerd? Is dit huismus mannetje er zeer bedreven in om meikevers te vangen? Of zijn meikevers gewoon makkelijk te vangen?

De natuur is wreed... maar er vallen ook slachtoffers door de mens:

Verkeersslachtoffer: volkomen platgereden!

Aan de andere kant zijn ze misschien ook niet zo slim. Waarom over een weg lopen als je kunt vliegen? Op een zandpad in het bos zag ik een nog levende meikever compleet met kop, maar met nog maar drie poten. Typisch een slachtoffer van een vogel (misschien ook een mus?).

Misschien is het een 'goed' meikever voorjaar, dus dat er dit jaar heel veel zijn? 

Zondag ochtend 4 mei alweer een mannetje bezig met de 11e meikever vlak voor de keukendeur. Zondag middag: de 12e. Hij heeft de smaak te pakken! Hoe smaakt een meikever eigenlijk? Dinsdag: nr 13! Woensdag: nr 14 en 15! Vrijdag 9 mei zie ik voor het eerst een mussenjong verschijnen. Zou het kunnen dat de nestjongen werden gevoerd met onderdelen van de meikever? Zondag 11 mei zie ik 3 mussenjongen! Ze hangen rond samen met de ouders in onze achtertuin. Het zijn de typische taferelen van jongen die bedelen om voedsel.

 

Bronnen

De Nederlandse Wikipedia weet te melden dat de meikever schadelijk is. Nu, als dat zo is, dan is de huismus een nuttige vogelsoort! Volgens de Engelse wikipedia worden de meikever larven door mollen gegeten. ...

29 April 2025

De aankomst van een bijenvolk in mijn achtertuin


Op zondag 27 april hoorde ik een enorm 'gezoem' in de achtertuin. Iemand in de buurt die een of ander elektrisch apparaat gebruikt? Nee. Het bleek een onvoorstelbaar grote wolk bijen te zijn die bij de vuurdoorn bleef rond dansen. 

Ik moet zeggen dat de schrik er wel eventjes in zat. Je weet niet wat je overkomt. En of het gevaarlijk is. En wat ze van plan zijn. Wat doen ze daar? Ik heb toen mijn camera gegrepen om dit zeldzame natuurverschijnsel vast te leggen. Ze vormden een massieve kluit in de hoogste tak van de vuurdoorn. De vuurdoorn is 4 meter hoog. Waarom bij ons in de vuurdoorn?  Deze bloeit nog lang niet. De tuinen in de buurt bevatten geen of weinig groen. Dat kan een factor zijn. Dit zou een tijdelijke 'tussenstop' zijn van een bijenvolk op zoek naar een nieuwe locatie. Dat blijkt vaker voor te komen. Heb een imker gebeld maar die kwam niet op zondag. Na een paar uur waren ze weer vertrokken. Ik weet niet waar ze vandaan kwamen en waar ze naar toegingen. Ik schat het aantal op 500 tot 1000.



Lukraak geschoten op de wolk bijen. Als je tientallen opnames maakt, zijn er door stom toeval wel een paar scherp. ObsIdentify heeft moeite met foto's van massa's door elkaar krioelende bijen, maar met een foto van een individuele bij komt hij toch op Honingbij Apis mellifera  (94%).

Tot slot een variant op een oude Chinese wijsheid: 1 bij hoor je niet, maar duizend bijen maken een oorverdovend lawaai! Ra ra, hoe kan dat?

 

Bronnen

Op de website van de Bijenstichting vind je diverse mogelijkheden om de leefomstandigheden van enkele bedreigde wilde bijensoorten te verbeteren. Koop uitsluitend biologisch geteelde bloemenzaden (U snapt wel waarom).

World Bee Day 20 mei 2025

World Bee Day is wereldwijd uitgeroepen door de Verenigde Naties om aandacht te vragen voor het belang van bijen.

26 April 2025

Geelzwarte wespbij: is het een wesp of een bij? of allebij?

Geelzwarte wespbij
Nomada succincta
Yellow legged Nomad Bee
22 april 2025 ©Gert Korthof

Op het eerste gezicht ziet dit insect er uit als een wesp. Maar het is een bij! Een wespbij. De natuur houdt zich niet aan onze indelingen. Maar waarom is het eigenlijk een bij? en geen wesp?

Deze wespbij zat op een bloem van een Daslook. Gewoon langs een weg langs de bosrand. Gelukkig bleef hij eventjes stil zitten. En ook nog mooi horizontaal. Dat is erg handig, want zo is hij van voor tot achteren scherp. En de bloemen vormen een mooie witte achtergrond. De zon scheen. Het waaide even niet. Uit de hand gefotografeerd zonder statief. Perfect. Ik wou dat alle opnames zo scherp waren!

Het blijkt dat deze wespbij geen 'normaal' leven te leiden. Deze wespbij is behoort tot het geslacht wespbijen (Nomada) en dat zijn nestparasieten of 'koekoeksbijen': ze maken niet zelf hun nest en verzamelen zelf geen stuifmeel, maar leggen hun eitje in het nest van een andere bij. Het is dus niet allemaal samenwerking (symbiose) in de natuur! Deze soort is niet de enige: het genus Nomada telt 49 soorten. Maar zoals op de foto te zien is: ze verzamelen kennelijk wel hun eigen voedsel. Wist ik allemaal niet.

De identificatie door ObsIdentify (waarneming.nl) is 100% en is ondertussen goedgekeurd door een moderator. En: het is een vrouwtje geworden. Waarom is mij niet duidelijk. Het is kennelijk uit de foto af te leiden.

Ter vergelijking: 


Honingbij (80%) 22 april (©G.K.)

Gewone wesp (92%) 20-08-2022 (©G.K.)


Bronnen

EIS Verspreidingsatlas Insecten

Gedetailleerde uitleg verschillen wesp en wespbij

Nederlands Soortenregister.

 

Technische details

Sony RX10-iv. t=1/8000 f/4,0 ISO 1000. Het is dus mogelijk om met ISO 1000 redelijk scherpe foto's te maken als de omstandigheden gunstig zijn. Een korte sluitertijd helpt natuurlijk altijd (in dit geval extreem kort). Ik vergroot de foto's nooit, ze worden alleen bijgesneden.

21 April 2025

Lonely Ring-necked Parakeet (Halsbandparkiet) on a rainy morning


Eenzame Halsbandparkiet ( Psittacula krameri ) op
een regenachtige ochtend in de krentenboom

The Ring-necked Parakeet is originally a bird from Africa but has established itself in the wild in the Netherlands. It very likely depends for a large part of food (peanuts) provided by humans, especially in the winter. Although it can be found in towns and villages, it is still shy of people. They mostly can be seen in small groups.

20 April 2025

10 April 2025

Big disappointment: KOBO ebook doesn't display figures and tables correctly

The Evolution of Imperfection

I have now 153 (non-fiction) e-books on my ten years old KOBO Auro HD reader. I never encountered problems with reading any of the books on it. A few days ago I bought Laurence D. Hurst (2025) 'The Evolution of Imperfection'. For the first time I discovered annoying problems with displaying content. In my e-reader a graph (Figure 6.1) is either displayed in an extremely small and consequently non readable size or is not displayed at all depending on the font size settings. 

To check whether this fault is specific to the e-reader, I checked the display in the online KOBO browser application. Unexpectedly, Figure 6.1 in chapter 6 refused to show up with any font size or page setting. A large table, Table 6.1, is only visible and readable at specific settings, but is truncated at more comfortable bigger font sizes.


Empty space where fig 6.1 should show up (browser)

However, the graph is definitely present in the e-book:

Display of the page in the e-book reader

As can be seen in the above picture, although the graph is displayed, and the caption is readable, the graph itself is so small that labels cannot  be read. This makes the illustration useless. This is not the only illustration that gives troubles For example, Figure 2.1, 2.2, 4.1, 5.1, 5.2 and 6.2 are also absent in the browser or too small in the e-reader. This is very annoying. The problem is that the illustrations don't scale with font size. The font size can be huge while the illustration is still microscopic. 

In a scientific book graphs and tables are essential. They are included for a good reason: they convey information. So, the book is kind of damaged and should not be sold in this condition. These errors make you think twice before buying a scientific e-book. The problem is of course that you don't know in advance.

Has anybody experienced similar problems? For example with the Amazon Kindle e-reader or browser?

The book is important for those interested in evolution, and I will blog about it as soon as I finished it.

 

update 5 May: Figure 6.2 added.

31 March 2025

Zonsverduistering fotograferen met een gewone digitale camera? Het kan! (29 maart 2025) Solar eclipse with standard digital camera

Solar eclipse 29 maart 2025 12:47 gedeeltelijke zonsverduistering
SONY A6400 90mm f/8,0 t=1/3200 sec ISO=1000

Niemand richt zijn camera op de zon. Je zou wel gek zijn. Maar het kan. Zonder je camera te beschadigen! Mijn eerste gedachte was: je moet de kortst mogelijke sluitertijd, het kleinste diafragma en de laagste lichtgevoeligheid (ISO) kiezen. Dat geeft de kortst mogelijke blootstelling aan het zonlicht. Onzin natuurlijk. Zelfs bij een gedeeltelijke zonsverduistering is het zonlicht veel te sterk en is het risico te groot dat de beeldsensor van de camera onherstelbaar beschadigd raakt. De beeldsensor is daar nu eenmaal niet voor gemaakt. Een zonsverduistering fotograferen is dus een veel grotere uitdaging dan een maansverduistering. Oplossing: een eclipsbril op de lens van de camera bevestigen.


SONY α6400 met eclipsbril

Met de eclipsbril voor de lens wordt het zoekerbeeld van de camera vreselijk donker. Dus het is even zoeken om de zon in het midden van het beeld te krijgen. Ik had de lichtgevoeligheid op ISO 1000 ingesteld om een korte belichting mogelijk te maken en met een diafragma van f/8,0 kwam ik op een sluitertijd van 1/3200 sec. Kort genoeg. De scherpstelling heb ik handmatig gedaan, visueel dus. Ondanks de eclipsbril ging het scherpstellen redelijk goed. De afstand is dan ongeveer oneindig ∞. Het resultaat is een redelijk scherp beeld. Het kan dus: een zonsverduistering fotograferen met een gewone digitale camera met een matige vergrotende telelens (90mm). De volgende keer (als ik de kans krijg!) gebruik ik een sterkere telelens in de hoop ook nog wat zonnevlekken te kunnen vastleggen...

Het weer was wisselend bewolkt met voldoende onbewolkte momenten. Je moet dus een beetje geluk hebben. De meeste mensen hebben totaal niets van dit hemelse verschijnsel gemerkt. Het verschil tussen een gedeeltelijke zonsverduistering en een zon die gedeeltelijk door wisselende bewolking bedekt wordt, valt gewoon niet op. Maar ik moet zo'n zeldzame gebeurtenis gewoon fotograferen!


Bronnen

12 March 2025

What exactly did Lynn Margulis contribute to science?

Lynn Margulis, a Scientific Rebel
Pushing the boundaries of knowledge in astrobiology.
NASA [21]

In my previous blogpost I remarked that Lynn Margulis deserved a Nobel prize for her endosymbiosis theory. This triggered a comment essentially denying the scientific merits of Lynn Margulis for evolutionary biology. It was claimed that Margulis was not the first to propose a symbiosis theory for the origin of mitochondria and chloroplasts and that she did not provide the DNA evidence. Here I provide evidence that during the critical 1960s and 70s mainstream science rejected and ridiculed the endosymbiosis theory and cytoplasmic heredity, whereas Margulis was defending this. Finally, I discovered two publications proving that she did publish DNA evidence.

Priorities, predecessors and prejudices

Indeed, there were predecessors of the symbiosis theory. However, previous publications were not generally known or, when they were noticed at all, they were ridiculed. For example, American biologist Ivan Wallin published in 1927 the book 'Symbionticism and the Origin of Species' proposing his version of the symbiosis theory. Unfortunately, "The reviews were so scathing that Wallin withdrew from scientific discourse. (...) To mainstream biologists, Wallin was little better than a crank." [1]. And according to wikipedia "Wallin and his works were largely forgotten, until Lynn Margulis introduced a more complete endosymbiotic theory with better evidences in 1967." [12].

Further, the Russian biologist Merezhkovsky "proposed that the organelles [chloroplasts] are actually cyanobacteria that took up residence in an early ancestor of plant cells. (...) That scenario was ignored or flatly rejected." (...) "But in 1966 decisive evidence for the validity of his proposal about mitochondria came with the discovery that these organelles have their own DNA." [2].

Additional evidence: the website 'Understanding Evolution' states: "Biologist Lynn Margulis first made the case for endosymbiosis in the 1960s, but for many years other biologists were skeptical. (...) Why should we think that a mitochondrion used to be a free-living organism in its own right? (...) Based on decades of accumulated evidence, the scientific community supports Margulis’ ideas: endosymbiosis is the best explanation for the evolution of the eukaryotic cell." [3].

Continuing from the same website:

"When one of her [Margulis] professors saw DNA inside chloroplasts, Margulis was not surprised. After all, that’s just what you’d expect from a symbiotic partner. Margulis spent much of the rest of the 1960s honing her argument that symbiosis was an unrecognized but major force in the evolution of cells. In 1970 she published her argument in the book The Origin of Eukaryotic Cells." [4].

Three big bangs that made genetics

Next, we need to place Margulis in the context of the history of genetics. In 1900 the rediscovery of Mendel made the first big bang in the biological sciences. The second was no less important: the identification of chromosomes as the physical location of Mendel's hypothetical factors. At the time this was called the Boveri–Sutton chromosome theory or the chromosome theory of inheritance. Nobody knows those name anymore. And it isn't a theory anymore. But it is an essential and necessary step in the construction of genetics as a science because the theory 1) located the hypothetical Mendelian factors on chromosomes, 2) showed elegantly that Mendels pairs of factors corresponded with pairs of chromosomes (homologous chromosomes). Amazingly, Mendel's theory predicted that we are all diploid creatures! Mendel never knew. The third big bang happened a decade before Margulis was trained as a biologist (1960s). That was the publication of the chemical structure of DNA by Watson and Crick in 1953. With a big bang molecular genetics became the most successful theory in the biological sciences. Together these 3 big bangs made genetics the most successful discipline within the biological sciences. Don't underestimate the feeling of triumph.

What is the relevance of all this? The relevance of these three discoveries for my argument is that chromosomes are located in the nucleus of the cell. In other words: 'genetics' was synonymous with chromosomal based heredity or nuclear heredity. This was the status of biology in the 1960s. Margulis was working in the shadow of mainstream nuclear genetics. She stubbornly decided to study extra-chromosomal inheritance or 'cytoplasmic heredity'. It is called 'cytoplasmic heredity' because mitochondria and chloroplasts are located in the cytoplasma of the cell. It was opposed to mainstream genetics in no less than 3 ways: non-chromosomal, non-nuclear (outside the nucleus or extra-nuclear) and non-Mendelian heredity. Cytoplasmic heredity was considered unimportant or controversial by the majority of geneticists. For example, Margulis quotes the Drosophila geneticist and Nobel Prize winner Thomas Hunt Morgan

"From the point of view of heredity, the cytoplasm of a cell can safely be ignored." [5] 

Margulis commented: "I considered it an arrogant oversimplification." I agree. In general it is 'amusing' and instructive to browse through old genetics textbooks to get a feeling of the thinking at the time [14]. Everybody knew that heredity was exclusively located in the nucleus of eukaryotes. It was an established truth. It wasn't even called 'nuclear genetics' or 'nuclear genes', because everybody knew that the hereditary material was located in the nucleus! 

Illustrative for the status of science is the statement of John Jinks (1964) in his monograph Extrachromosomal inheritance

"There have been increasingly persistent claims that DNA is present in structures such as plastids and mitochondria." [10]. 

 Please note that 'claims' means not proven ideas.

In A History of Genetics the genetics pioneer A.H. Sturtevant (1965) wrote: 

Sturtevant 1965
A History of Genetics

"Quite recently it has been found that there is DNA in plastids and at least some mitochondria. ... It may therefore be supposed that these bodies carry genes of the same nature as those in the chromosomes" [6]. 
It must have been a disturbing discovery for those unaware of the symbiosis theory. See for example what historian of science Jan Sapp wrote:
"The symbiotic theory of eukaryotic organelles attracted criticism from many sides during the 1970s. Crucial evidence was lacking. ... Leading cell biologists also argued that theories about eukaryotic cell origins were unscientific because they could not be proven." (!) [7]. (my emphasis)

That was how biologists used to think at the time. In 1972 Tribe and Whittaker wrote in their monograph Chloroplasts and Mitochondria:

"Up until the last few years, it was generally assumed that the total information necessary for the synthesis of a cell resided in the DNA of the nucleus." [8].

Indeed! Remarkably, at the time it was uncertain whether mitochondria and chloroplasts could divide at all, or whether they were synthesized de novo (from scratch). It was also a problem how much of the DNA in mitochondria and chloroplasts was functional at all and, if functional, what role it played. Furthermore, the authors point out two major objections to the symbiotic theory [9]. So, my point is that one should not ignore the status of biology at the time Margulis was working.


DNA evidence!

The blog commenter also claimed that Margulis did not provide DNA evidence for the symbiosis theory. This is not correct. I discovered an ignored publication: 

L. Sagan (1961) Evidence for cytoplasmic DNA in Euglena gracillis [11] in the  Journal of Protozoology

This publication is not listed in the Lynn Margulis wikipedia page. Unfortunately, google scholar returns the title only, not the contents, not even an abstract. However, the title is revealing [12]. The most reliable and exemplary demonstration of DNA in plastids is given by S. Nass and M.K. Nass (1963) [13]. From the fact that they perform extensive control experiments, it is clear that they are aware that extraordinary claims require extraordinary evidence. They wanted to exclude any contamination with nuclear DNA or other false positives. At the time these authors were not interested in evolutionary explanations and did not interpret the DNA as evidence for symbiosis theory. They were busy unraveling the structure and function of cellular organelles. No time for speculation. This shows that the discovery of DNA in mitochondria occurred independent of the symbiosis theory. On the other hand knowledge of the symbiosis theory would be an excellent reason to search for DNA in mitochondria. Nass & Nass came incredibly close to the discovery of an evolutionary symbiosis theory with this quote : "a structure homologous with the mitochondrion is the entire bacterial cell." That statement is still not a symbiosis theory. The most far-reaching conclusion they dared to draw was:

"In any case, the presence of D N A in mitochondria appears to require modification and extension of some generally accepted hypotheses of cell function which consider the nucleus to be the exclusive site of cellular D N A and genetic information." [13].

Indeed. Clearly, the authors doubted a well established truth. It was the first step towards a symbiosis theory. Lynn Margulis devoted herself to developing a comprehensive symbiosis theory.

Principles of Population Genetics

'Symbiosis' is still a sensitive subject. A stunning demonstration is
the textbook Principles of Population Genetics [15]. Many pages are devoted to describing all genetics aspects of mitochondrial DNA (mtDNA) and chloroplast DNA (cpDNA). And those aspects are without doubt useful for understanding certain aspects of evolution. However, endo-symbiosis is never mentioned. It is not that mitochondria are absent. It is not that mitochondrial DNA is absent. No. It is the word 'Symbiosis' that is absent. It doesn't occur in the index. I find that really baffling. Is symbiosis so far beyond the scope of population genetics? It seems symbiosis does not fit in the theory of population genetics. Could it be that the origin of mitochondria and chloroplasts can not even be described by the most advanced mathematical population genetic models? If true, than it clearly shows the limits of population genetics for understanding all the facts of evolution of life on earth. Symbiosis is not a rarity [19].

A second paper of DNA evidence by Lynn Margulis is:

L Sagan, Y Ben-Shaul, HT Epstein, JA Schiff (1965) 'Studies of chloroplast development in Euglena. XI. Radioautographic localization of chloroplast DNA', Plant physiology 1965 Nov;40(6):1257–1260. (pdf). (Note: at the time Lynn Margulis published under the name L. Sagan because she was married with Carl Sagan.)

This publication does not occur in wikipedia either. The authors conclude that chloroplasts (like mitochondria) contain DNA and RNA; they are self-duplicating bodies which do not arise de novo; the DNA represents a multigenic hereditary system which is not derived from the nucleus and is, in part, responsible for the biochemical properties of the organelle. In her 1967 paper On The Origin of Mitosing Cells she made the prediction that all eukaryotes should contain mitochondrial DNA and all eukaryotic plants should contain chloroplast DNA. Also in that 1967 paper she refers to  (Sagan, L., 1964, unpublished data) [16]. 

We should not be surprised that Margulis worked on DNA evidence! Her thesis was: 'An Unusual Pattern of Thymidine Incorporation in Euglena', 1965 (mentioned in wikipedia). The abstract can be found in the The Journal of Protozoology (published under the name Lynn Sagan). Although the results are confusing and inconclusive, the thesis shows that she used techniques to detect DNA in the cytoplasm. (Thymidine is a component of DNA).  Interestingly, in the References of her thesis I found 3 other publications with L. Sagan as author:

  1. Sagan, L. & Scher, S. 1962. Cytoplasmic incorporation of H3-thymidine in Euglena gracilis. J. Protozool. 8, Suppl. 20.
  2. Plaut, W. & Sagan, L. A.*) 1958. H3-thymidine incorporation into the cytoplasm of Amoeba. (pdf) J. Biophys. Biochem. Cytol.**) 4, 843–7.
      *)  Lynn Petra Alexander Sagan Margulis (1938-2011)
    **) "Content prior to 1962 was published under the journal name The Journal of Biophysical and Biochemical Cytology."
  3. Sagan, L., Ben-Shaul, Y. & Schiff, J. A. 1964. Radiographic localization of DNA in the chloroplasts of Euglena. Abstracts of the 4th Annual Meeting of the American Society for Cell Biology, Cleveland, Ohio.

These three publications do not occur in Wikpedia.The publications prove that Margulis started working on DNA in 1958 or earlier. That is 5 years earlier than Nass & Nass (1963) [18].


Conclusion

The claim that Margulis was not the first to propose a symbiosis theory is right. However, that is not the point. The point is that the symbiosis theory was disregarded at the time when Margulis started working on the subject. The evidence presented here shows that it was risky and unpopular to study and publish about the symbiosis theory during the 1960s and 1970s. Margulis (1967,1970) elaborated the theory and provided enough initial evidence to justify further research into the theory. Furthermore, I showed that the claim that she did not come up with DNA evidence is wrong. She produced 5 - 6 publications. The symbiosis theory provided a correct evolutionary explanation for why there is DNA in mitochondria and chloroplasts.

Now we have reached this conclusion, it is useful to compare Darwin and Margulis. Darwin did not prove his theory in 1859. Neither was he the first to propose a theory of evolution. And his theory was very controversial at the time. But, Darwin provided enough reasons for his contemporaries to take the theory serious. Subsequent generations of biologists have shown that the theory was indeed worth investigating and came with abundant evidence. It is now an accepted theory. The same holds for the endosymbiosis theory.

I am not the only one with a positive assessment of the contribution of Lynn Margulis to the theory of evolution. For example Michael Ruse and Joseph Travis [17] wrote:

"But it was Margulis who took up the idea, now known as the endosymbiotic theory, offered microscopic evidence, and pushed it (in her book Origin of Eukaryotic Cells, 1970) until it became orthodoxy.".

And the architects of the Evolutionary Synthesis wrote:

"The most complete hypothesis is that of Margulis (1970), who has marshalled a great wealth of morphological, biochemical, and paleontological facts ... ". [20].

Notes

  1. Lynn Margulis, Dorion Sagan (1997) Slanted Truths chapter 4, page 50.  
  2. Lynn Margulis, Dorion Sagan (1997) Slanted Truths, chapter 3, page 38.
  3. Website Understanding Evolution page 'Evidence for endosymbiosis' of the Berkeley museum of paleontology. (by the way, very good website!)
  4. The full title: Origin of eukaryotic cells;: Evidence and research implications for a theory of the origin and evolution of microbial, plant, and animal cells on the Precambrian earth (1970) Yale University Press. (still available at amazon). See also: the website Understanding Evolution page Endosymbiosis: Lynn Margulis
  5. Lynn Margulis (1998) The Symbiotic Planet. A new look at evolution, hardback, page 22.
  6. A.H. Sturtevant (1965) A History of Genetics page 125 chapter 19 'Maternal Effects'. Sturtevant refers to: Gibor and Granick (1964) Science 145: 890-897. This publication is also referred to by Margulis (1967). 
  7. Jan Sapp (2003) Genesis. The Evolution of Biology. page 246.
  8. Michael Tribe, Peter Whittaker (1972) Chloroplasts and Mitochondria. page 54.
  9. idem page 57.
  10. John L. Jinks (1964) Extrachromosomal inheritance. Prentice-Hall. p.89. Dutch: John L. Jinks (1968) Extrachromosomale erfelijkheid. Het Spectrum. paperback, pagina 132. He did not refer to publications. 
  11. Sagan, L, Evidence for cytoplasmic DNA in Euglena gracillis, Journal of Protozoology 8 4: 20 (1961). Euglena is a single-celled eukaryote. 
  12. I found the publication via the references in Lynn Sagan (1967) On the origin of mitosing cells (her first publication. It is a large, complex, wide-ranging publication). She writes: "A plethora of recent studies elegantly reviewed by Gibor & Granick": A. Gibor and S. Granick (1964) Plastids and Mitochondria: Inheritable Systems: Do plastids and mitochondria contain a chromosome which controls their multiplication and development? Science 28 Aug 1964. Only the Abstract is available, but, amazingly, I discovered in the References of G&G: "L. Sagan (1961)" [11].  
  13. S. Nass and M.K. Nass (1963) Intramitochondrial fibers with DNA characteristics. II. Enzymatic and Other Hydrolytic Treatments. J Cell Biol 1963 Dec 1;19(3):613–629. A pdf is available.
  14. For example the genetics textbook Srb, Owen, Edgar (1965) General Genetics, Second edition, hardback, which I still have on my bookshelf, contains a chapter 'Extrachromosomal and Epigenetic Systems'. That is great. But browsing through the pages reveals that the most important criterion for extrachromosomal inheritance is simply that it does not obey the laws of Mendel and must be located in the cytoplasma. Mitochondria and chloroplasts are mentioned, but at the time it was impossible to prove that these organelles contain DNA. It was an open question whether extrachromosomal heredity relies on 'coded information'. "Extrachromosomal heredity has reality, and manifests itself in almost bewildering variety." (p.345). There is no mention of '(endo)symbiosis'. How amusing and useful a little time travel can be!
  15. Hartl & Clark (1997) Principles of Population Genetics, third edition. Sinauer Associates. hardback. 
  16. "This is quite analogous to the presence of two distinct DNA bands of nearly equal size found in CsCl density gradient runs on DNA isolated from Paramecium bursaria (Sagan, L., 1964, unpublished data). 
  17. Michael Ruse, Joseph Travis (2009) Evolution. The First Four Billion Years,  Harvard University Press, hardback, 979 pages. page 712-713. This is just one example. The influential evolutionary biologist John Maynard Smith recognized her contribution to science; see my review of Lynn Margulis.
  18. This paragraph was added 14 Mar 2025. See for a summary of the first attempts to demonstrate cytoplasmic DNA: William A Wells (2005) There's DNA in those organelles J Cell Biol. 2005 Mar 14.
  19. Nancy A. Moran (2025) 'Symbiosis. A Very Short Introduction', Oxford University Press. 192 pages. "The majority of evolutionary biologists continue to regard symbiosis as a marginal process that can mostly be disregarded."  15 Mar 2025
  20. Dobzhanksy, F.J. Ayala, G.L. Stebbins, J. Valentine (1977) 'Evolution', W H Freeman and Company. hardback. page 383–389. The book is a comprehensive overview of the theory of evolution as it was at that time. 17 Mar 2025 
  21. I discovered this beautiful illustration of Lynn Margulis as an Astrobiology Hero on a NASA website! I immediately replaced the wikipedia Lynn Margulis portrait with this illustrataion. 5 April 2025