02 August 2025

Senapathy algorithm undermines his own theory of independent birth of organisms in the primordial pond

In his Wikipedia article Periannan Senapathy, paragraph 'Origin of split genes from random DNA sequences', he explains why eukaryotic genes have a split structure or an exon - intron structure. His explanation is: genes and genomes with this structure originated from random DNA sequences in the Primordial Pond. 

The structure of a split gene: exon-intron
Exons (blue) are the protein coding parts of a gene,
introns are the non-coding parts which are removed,
the combined exons produce the protein

The problem with this explanation is: if a hypothetical gene has a random sequence than everything from begin to end is random, including the supposed 'exon-intron' boundaries. Since a gene is a continuous sequence of the bases A, T, C, G, how do you know where an exon ends and an intron starts? Introns have to be recognized somehow in order to get removed. In all animals and plants with split genes (eukaryotes) recognition is achieved by special splice site recognition sequences which are located at the beginning and end of each intron. In fact those sites define introns. And by implication they define beginning and end of exons too (see illustration). Without those special sites, exons and introns cannot be distinguished. In Senapathy's scenario of independent birth of all plants and animals, both exons and introns are by definition random sequences anyway. My point is that these boundaries are specific and therefore non-random [1], [2]. Consequently, there is no way that these non-random splice sites occur in random DNA. Impossible. 

Think about this: human genes contain on average 8 introns, that is 16 splice sites per gene. Since humans have about 25,000 genes, there are about 400,000 splice sites. A few could occur by chance, but not 400,000. 

My argument can be summarized in one sentence: 

  • Either a sequence is random, and then there can be no well-defined splice recognition sites, and thus no exons and introns 
  • or there are splice recognition sites, and exons and introns, but then the sequence is not random any more. [3]

I discovered additional evidence in Senapathy (1987) [2]: 

"A sequence of eight nucleotides is highly conserved at the boundary between an exon and an intron (...) The boundary between an intron and an exon also exhibits a highly conserved sequence of 4 nucleotides, preceded by a pyrimidine-rich region." 

So, he knows that these are non-random sequences. The rest could have been random, but not those specific sequences. He should have concluded that the exon-intron structure of eukaryotic genes cannot arise from random DNA. The same holds for genomes. And the same holds for the organisms themselves. The inescapable and final conclusion is that the origin of eukaryotes (all plants and animals) cannot be explained by random DNA. Sorry, there is no escape from this conclusion. Unfortunately,  Senapathy failed to explain the origin of life. His Primordial Pond will not be and can not be the birthplace of eukaryotes, plants and animals. Under the most favourable conditions, his Primordial Pond will only contain dead and meaningless random DNA molecules. If he is lucky, it will produce a lot of dead and meaningless random DNA. But nothing more. It is a primordial soup, and it stays that way forever because there is no evolution in his scenario. His primordial pond will not bring forth life.

Ironically, the very existence of his Shapiro–Senapathy algorithm undermines his own theory of Independent birth of organisms from random DNA sequences. For example, on his Wikipedia page he writes:

"The Shapiro–Senapathy algorithm has been used to determine the various aberrant splicing mechanisms in genes due to deleterious mutations in the splice sites, which cause numerous diseases." (accessed 7 Aug 2025)

He lists 6 cases where a single base substitution (point mutation) in an intron splice site causes a disease (cancer). Now, if a single base substitution causes disease, it means that splice sites are highly specific. If they are highly specific, then they can't be random. Yes, a few splice sites could arise in random DNA, but not 400,000 (see above).

 

Notes

  1. "A splice site defines the boundary between a coding exon and a non-coding intron in eukaryotic genes." quote from Wikipedia article: Shapiro–Senapathy algorithm (This page was last edited on 28 July 2025, at 14:35 (UTC).) 
  2. M. B. Shapiro, P. Senapathy (1987) RNA splice junctions of different classes of eukaryotes: sequence statistics and functional implications in gene expression, Nucleic Acids Res 1987. This publication appeared 7 years before his 1994 book.
  3. Yes: START and STOP codons are non-random, too. They do appear with reasonable frequencies in random sequences. But splice sites have a minimum length of 8 and 4 bases (12 together), not 3. Theoretically, and paradoxically, any non-random sequence can occur in a random sequence. Your password can appear in a random sequence! It's all about frequencies. Furthermore, the task is to calculate the probability of the combination of Start codons, Stop codons and splice begin and end codons. [10 Aug 2025]

updated 10 Aug 2025

 Sources

  • Wikipedia article Periannan Senapathy (last edited 16 July 2025)
  • Wikipedia article Shapiro–Senapathy algorithm (last edited 28 July 2025)
  • Wikipedia article Split gene theory (these three Wikipedia articles are written by Senapathy supporters or by himself and give the false impression of being mainstream science and omitting any criticism)
  • Gert Korthof What's Wrong with Independent Birth of Organisms? (this is my criticism of Senapathy's theory)
  • Periannan Senapathy (1994) 'Independent Birth of Organisms. A New Theory That Distinct Organisms Arose Independently From The Primordial Pond Showing That Evolutionary Theories Are Fundamentally Incorrect'. (now more than 30 years old, the book is still available at amazon).

Previous blog posts related to Senapathy

    29 July 2025

    Kolibrievlinder: kruising tussen vlinder en kolibrie

     

    Kolibrievlinder bij vlinderstruik 29 juli 2025

    Kolibrievlinder bij vlinderstruik 29 juli 2025

    Kolibrievlinder bij vlinderstruik 29 juli 2025

    Kolibrievlinder bij vlinderstruik 29 juli 2025

    De Kolibrievlinder (Macroglossum stellatarum) blijft toch altijd een unieke vlinder! Ik ben zeer vereerd dat hij onze Vlinderstruiken bezoekt! Het is toch wel met stip de mooiste vlinder die je in je tuin kunt hebben. Hij heeft iets on-Nederlands, iets exotisch. Heel bijzonder dat hij hier in de buurt nog rondvliegt in tijden van achteruitgang van de meeste vlinders. Mocht je hem nog niet kennen, dan is het nu wel duidelijk waarom hij de Kolibrievlinder heet! Houd je vlinderstruiken in de gaten! Hij was na een paar minuten al weer weg. Op de foto zie je dat de tong bijna net zo lang is als het hele dier. Let ook op het 'staartje': uniek voor een vlinder; het lijkt precies op de staart van een vogel zoals de Kolibrie. En hij lijkt hem ook op dezelfde manier te gebruiken.

    On-Nederlands

    het lijkt een exoot o.a. omdat het dier een tong heeft die veel te lang lijkt voor de bloemen die in Nederland in het wild voorkomen. Volgens waarneming.nl is het geen exoot maar nota bene een algemene en inheemse soort!









    12 July 2025

    A Remarkable Place To Die: Huisspitsmuis dood gevonden in onze tuin

    Huisspitsmuis † Crocidura russula
    11 juli 2025

    Als je voelt dat je dood gaat, ga je dan op de bestrating liggen? Of kruip je weg in een donker hoekje om rustig te sterven? En die zijn er genoeg. Maar,  we vonden dit beestje, 8,7 cm van kop tot staart, 's ochtends op de bestrating in onze tuin. In plain sight

    Er kropen al tientallen mieren over en rondom het beestje. Mieren hebben kennelijk een goede neus. Doodsoorzaak onbekend. Geen uiterlijke verwondingen. Geen bloed. We hebben alle mogelijke maatregelen genomen om katten uit onze tuin te weren. Toch weet je het niet. Een ekster? Een Vlaamse gaai? Een virusziekte? Gewoon ouderdom? Aangevallen door een soortgenoot die zijn territorium verdedigde? In Nederland worden huisspitsmuizen regelmatig dood gevonden. Komt dat misschien omdat dode huisspitsmuizen makkelijker waar te nemen zijn dan levende? Opvallend: dezelfde dag meende ik nog een Huisspitsmuis tussen de beplanting te zien rondlopen.

     

    Twee opvallend lange snijtanden in de kleine onderkaak

    Merkwaardig detail: twee opvallend lange snijtanden in het midden van de onderkaak tegenover twee kleine snijtanden in de bovenkaak. De hele kaak ziet er wat onevenwichtig uit. Het lijkt mij onhandig. Heeft het voordelen? Let ook op de lange snorharen.

    Er komen 7 spitsmuizen voor in Nederland waarvan 3 algemeen:

    We zien al jaren de Gewone bosmuis ( Apodemus sylvaticus ) (dat is geen spitsmuis) in onze tuin (opvallende oren!), maar hadden de Huisspitsmuis nog niet gezien. Ik heb over de Gewone bosmuis al in 2012 geblogd. En we zagen hem 's nachts op de wildcamera verschijnen en soms zelfs heel brutaal gewoon overdag. Maar dat is dus een andere soort.

     

    Bronnen

    Waarneming geeft 7 spitsmuizen in Nederland. Ze zijn van 3 geslachten (genus, genera), dus de naam 'spitsmuis' zegt niet alles!

    Waarneming geeft 27 soorten met 'spitsmuis' in de naam, waarvan 19 kevers! 

    Zoogdiervereniging geeft zeer bruikbare en interessante beschrijvingen ('Een huisspitsmuis kan maximaal 2 tot 3 jaar oud worden, maar slechts een zeer klein deel overleeft een tweede winter'! )

    24 June 2025

    Deze Vlaamse Gaai is totaal verzot op pinda's midden in de zomer!


    Ik had nog een netje met pinda's hangen dat overgebleven was van de winter. Geen vogel had er nog belangstelling voor. Maar kortgeleden zag ik een Vlaamse gaai (zo heette hij in mijn tijd, tegenwoordig: Gaai, Garrulus glandarius) die er de nog goede pinda's wist uit te vissen. Een fraai gezicht!

    Vlaamse Gaai bezig met pinda's ©GK

    Eerst alleen op rustige tijden 's ochtends vroeg of 's avonds tegen de schemering. Maar na een tijdje ook gewoon overdag. Hij raakte een beetje aan ons gewend. De pinda's raakten op en bij tuincentra en supermarkten waren er geen vogel pinda netjes meer te koop. Toen maar bij Ekoplaza biologische pinda's voor menselijke consumptie gekocht! Ik hing een zelf gemaakte pindahouder op en de Gaai bleef terugkomen. Het smaakte hem/haar blijkbaar goed. Toch vreemd, want volgens gezaghebbende informatiebronnen eten Gaaien alleen in de winter eikels, beukennootjes, hazelnootjes, etc. Zou het kunnen dat dit een broedend vrouwtje is die even snel wat voedsel naar binnen slaat, om dan weer gauw terug naar haar nest te gaan? Mannetje en vrouwtje zijn niet te onderscheiden. De nootjes worden niet meegenomen naar het nest (als dat er is).

    Volgens de Vogelbescherming was de Gaai vroeger een uitgesproken bosvogel, maar is deze vogel ondanks schuw gedrag steeds vaker in de stad te zien. Dat klopt dus. Maar wij vinden het nog steeds bijzonder om hem in onze tuin te observeren. Voor ons is en blijft het een bosvogel.

     

    Pimpelmees

    Een pimpelmees jong toont ook belangstelling:

    pimpelmees jong 30 juni 2025

    koolmees 6 juli 2025



    Vorige blogs

     

    Bronnen

    • Vogelbescherming: Gaai 
    • Waarneming: Gaai met opsomming alle ondersoorten
    • Wikipedia: Gaai vertelt meer over de naam in verschillende talen.
     
     

    10 June 2025

    Een zwartbuikkoolmees: een superaantrekkelijk mannetje voor de vrouwtjes of een melanistische mutant?

    Zwartbuik koolmees 27 mei 2025 (©GK)

    Onlangs zag ik een heel bijzondere koolmees. Hij heeft een vrijwel geheel zwarte buik. Normaal hebben koolmees mannetjes een gele borst met een zwarte verticale streep op keel en borst. Het zwart in de foto komt niet door schaduwwerking. Het is echt een zwarte buik. Ter vergelijking: er is op de kop wit te zien en het bovenste deel van de borst is gelig. Ook de vleugel is donkerder dan normaal.


    koolmeesman 2 juni 2025 (©GK)

    Hier zijn nog 2 foto's van latere datum van vermoedelijk hetzelfde individu. Ik denk dat dit niet een willekeurige variate is, maar dat het verklaarbaar is. In wetenschappelijke publicaties kom je tegen dat vrouwtjes mannetjes met een brede borststreep prefereren [1],[2]. Ik kan me voorstellen dat door de onderliggende genetica van die zwarte borststreep er een keer een variant ontstaat waarbij de zwarte borststreep zich extreem heeft uitgebreid. Vrouwtjes zouden dat extra aantrekkelijk kunnen vinden. Daartegenover staat dat het contrast van een zwarte streep tegen een gele achtergrond helemaal wegvalt. 

    Op de eerste foto is te zien dat de koolmees een rups in zijn snavel heeft, hij heeft dus een nest met jongen en dus een partner! Dat is gelukt!

    Tot nu toe heb ik nog geen waarnemingen of literatuur gevonden over koolmezen met extreme zwarte borst.

     

    Zo ziet een normale koolmees man er uit.
    Foto: Marleen (waarneming.nl)

     


    Literatuur

    1. Mate Choice in Double-Breeding Female Great Tits (Parus Major): Good Males or Compatible Males, 11 January 2021. "Double-breeding females prefer males with large breast stripes,..."
    2. The great tit abdominal stripe contains a sexually dichromatic colour patch hidden from the human eye. Deze publicatie gaat met name over de UV patronen die koolmezen zouden zien ('bird-visible'), maar laat ook verschil man-vrouw goed zien: vrouw links, man rechts ('human-visible').
    3.  

      Bron: publicatie [2]

    4. Dutch Birding: koolmees met zwarte kop (met dank aan Klaas van Dijk) 
    5. website strandloper.nl met Koolmees met melanisme (met dank aan Klaas van Dijk) 
    6. Melanistische Pimpelmees in Heuvelland (W) (natuurpunt.be) met uitgebreide toelichting. (met dank aan Klaas van Dijk) 
    7. Hein van Grouw (2006) Not every white bird is an albino: sense and nonsense about colour aberrations in birds. Dutch Birding 28: 79-89, 2006 (met dank aan Klaas van Dijk)



    ObsIdentify

    Het is altijd interessant hoe het beeldherkenningsprogramma ObsIdentify (waarneming.nl) afwijkende koolmezen en pimpelmezen identificeert. Wat zijn de essentiële kenmerken van deze soorten in de ogen van ObsIdentify? Hoeveel afwijking kan ObsIdentify verdragen voordat het helemaal fout gaat? Dit experiment geeft verrassende resultaten:

    Koolmees 31%
    Dutch Birding

    Atlasvink 81% (!) Fringilla spodiogenys africana
    zie ook foto beneden.  bron

    Koolmees 59% bron

    Koolmees 38% bron

     
    Koolmees 100% (!) bron

    Pimpelmees 72% bron

    Pimpelmees 92% bron

    Pimpelmees 82% bron


    Fringilla spodiogenys africana. bron
    (zie boven). Hierdoor wordt het begrijpelijk waarom ObsIdentify de fout maakte!
    Deze soort lijkt een melanistische vorm van onze Europese vink!
    Tegelijkertijd betekent het dat Obs. trainingsdata moet hebben gehad van niet-Europese vogels.




    31 May 2025

    Een sfeervolle avondwandeling met een zeer relaxte ree


     

    Na een bewolkte en regenachtige dag met zo nu en dan hevige stortbuien, begint 's avonds de zon door te breken.  Dan spot ik een ree die zich van niemand iets lijkt aan te trekken.

    Hij doet gewoon zijn ding. Hij is kennelijk gewend dat mensen hem niet dicht kunnen naderen vanwege een sloot. Het is een klein landgoed van het Utrechts Landschap en ligt ingeklemd tussen drukke wegen. Er wordt sowieso niet gejaagd en zijn er geen wolven. Het gebied is niet toegankelijk voor honden.  De rustige sfeer komt goed tot uiting in de zang van merels en andere vogels op de achtergrond. Iedereen, mens en dier, is blij met een uurtje zon na een regenachtige dag. Na een paar hapjes bladeren van de struiken verdwijnt het dier weer in het dichte struikgewas.

     

    Technische gegevens

    Deze video is ook een aardige demonstratie van het zoombereik van de Sony RX10-iv (een 24 - 600mm zoom bridgecamera). Opname 28 mei 2025.

    25 May 2025

    Een belediging voor Charles Darwin: deze bizarre larve van een lieveheersbeestje spot met de wetten van camouflage


    Als het diertje een schutkleur had gehad, had ik hem zeker niet gezien! Het lijkt nog het meest meest op een kluwen witte wol met pootjes. Als hij niet gelopen had, zag je niet dat het überhaupt een dier was. En wat een zuivere witte kleur! Hoe kan dat een schutkleur zijn?! Een belediging voor Charles Darwin! Zijn ze misschien giftig voor vogels? Is het een waarschuwingskleur? Zijn ze oneetbaar door die stekels? Smaken die beestjes vies? De meeste larven van lieveheersbeestjes zien er totaal anders uit. En wat zijn dat voor uitsteeksels op zijn rug? Veertjes? Pluizen? Haren? Het blijft bizar! Het is een larve van een lieveheersbeestje. De precieze soort is niet vast te stellen. Op de pagina van de familie Lieveheersbeestjes staat geen foto van deze larve.

     

    Bronnen

    youtube (mijn filmpje)

    waarneming.nl : Scymninae indet betekent niet vast te stellen soort van de subfamilie Scymninae. Waarneming.nl heeft een pagina Scymninae indet. waar wel een foto van het beestje staat. De Engelse Wikipedia pagina: Scymninae

    De Onderfamilie SCYMNINAE worden ook wel Dwergkapoentjes !  genoemd (Nederlands soortenregister).

    Familie lieveheersbeestjes (waarneming.nl)

    BNNVARA maakte er in 2017 een pagina over met allerlei interessante wetenswaardigheden en een fraaie foto: Larve blijkt wolf in schaapskleren (ik ben het niet met alles eens!). Wist ik niet toen ik dit blog schreef.

    Technische details: Sony A6400 90mm macrolens.

    21 May 2025

    Nocturnal visit of a Stone Marten - Nachtelijk bezoek van een Steenmarter (met update)


    Dit dier is 's nachts door een wildcamera vastgelegd. Dit is een uitzonderlijke succes voor een wildcamera. Totaal onverwacht. Ik had van te voren geen enkele indicatie dat er op deze plek een hermelijn of steenmarter zou kunnen rondlopen. Ik had ook geen voer neergelegd behalve de vorige dag wat broodkruimels voor mussen en muizen, maar dat was al op. Het enige was een drinkbak met water. Maar daar heeft het dier niet van gedronken ondanks de wekenlange droogte. Het gaat om twee nacht opnames 15 en 16 mei achter elkaar gemonteerd. Mogelijk hetzelfde individu omdat het op dezelfde locatie is.

    Volgens mij is dit een Hermelijn (Mustela erminea) en geen Steenmarter 100% (Martes foina) zoals ObsIdentify aangeeft. De staart met donkere pluim is niet van een Steenmarter.

    Ik heb de waarneming in waarneming.nl ingevoerd en wacht op goedkeuring.

    Update 22/23 mei: volgens de moderator JFK van waarneming.nl is dit een Steenmarter (Martes foina). Zijn uitleg is:

    "Een hermelijn is een heel slanke, dun gebouwde marter. Qua bouw is het eigenlijk een soort dubbele muis. Bij een hermelijn is niet alleen de borst wit, maar ook de hele buik. De staart is kort en met een duidelijke zwarte punt. De steen- en boommarter zijn de twee grote marters in Nederland. Fors gebouwd en met een lange, pluizige staart. De twee zijn lastig uit elkaar te houden, maar dit is een steenmarter omdat het dier niet zo hoog op de poten staat als een boommarter, de oren vrij ver uit elkaar staan en de witte bef loopt door tot op de voorpoten (bij een boommarter niet). "

    Ik heb de soortnaam daarom in Steenmarter gewijzigd. Heel passend meldt waarneming.nl bij Steenmarter:

    "Tot voor kort golden steenmarters als nagenoeg uitsluitend nachtactief – zelfs in die mate dat dit als bruikbare indicatie voor het onderscheid tussen boom– en steenmarter kon gelden bij vluchtige veldwaarnemingen."

    Conclusion: according to an expert (associated with observation.org) this is a Stone Marten (Martes foina), not a Stoat. 


    Bronnen

    youtube

    waarneming.nl 

    Steenmarter 

     

     

     

     

     

     

    03 May 2025

    Carnivore huismus! De natuur is wreed...Het is lente!


     

    Een carnivore huismus! Wie had dat gedacht? We kennen de huismus als een gezellige, vredelievende, onschuldige zaadeter. Maar in het voorjaar verandert dit gezellig tjilpende beestje in een fanatieke carnivoor: hij verorbert meikevers zo veel als hij te pakken kan krijgen. 

    De afgelopen 3 dagen heb ik een mannetje huismus al bezig gezien met 10 meikevers. Tot nu toe alleen mannetjes. En dat zijn alleen de keren dat ik het gezien heb. Het moeten er dus meer zijn. Dit mannetje is er kennelijk zeer bedreven in. Ik heb nog geen vrouwtje hetzelfde zien doen. Ik heb geen idee waar hij ze vandaan haalt. Ik zie ze niet in onze tuin vliegen.

    Koploze meikever met 2 losse dekschilden, en twee vleugels

    Van de teruggevonden kevers ontbreken kop, poten, dekschilden en vleugels. Misschien wordt de kop als eerste en enige opgegeten? Zo kan het beestje er immers niet meer van door gaan. Zou ik denken. Maar, ik heb ook een nog levend beestje gevonden waarvan alle pootjes er af waren en het met de stompjes die nog over waren zinloze loopbewegingen maakte. Een triest gezicht.

    Ik zie wel dat er iets gegeten wordt. Maar het lijkt er op dat het middenstuk nooit wordt gegeten. Alleen de kop? De vleugels en dekschilden worden in ieder geval niet op gegeten, want die vind je terug. De poten heb ik niet teruggevonden. Die lijken me ook niet echt eetbaar. Worden die arme beestjes dan vooral als plezierig tijdverdrijf levend gedemonteerd? Is dit huismus mannetje er zeer bedreven in om meikevers te vangen? Of zijn meikevers gewoon makkelijk te vangen?

    De natuur is wreed... maar er vallen ook slachtoffers door de mens:

    Verkeersslachtoffer: volkomen platgereden!

    Aan de andere kant zijn ze misschien ook niet zo slim. Waarom over een weg lopen als je kunt vliegen? Op een zandpad in het bos zag ik een nog levende meikever compleet met kop, maar met nog maar drie poten. Typisch een slachtoffer van een vogel (misschien ook een mus?).

    Misschien is het een 'goed' meikever voorjaar, dus dat er dit jaar heel veel zijn? 

    Zondag ochtend 4 mei alweer een mannetje bezig met de 11e meikever vlak voor de keukendeur. Zondag middag: de 12e. Hij heeft de smaak te pakken! Hoe smaakt een meikever eigenlijk? Dinsdag: nr 13! Woensdag: nr 14 en 15! Vrijdag 9 mei zie ik voor het eerst een mussenjong verschijnen. Zou het kunnen dat de nestjongen werden gevoerd met onderdelen van de meikever? Zondag 11 mei zie ik 3 mussenjongen! Ze hangen rond samen met de ouders in onze achtertuin. Het zijn de typische taferelen van jongen die bedelen om voedsel.

     

    Bronnen

    De Nederlandse Wikipedia weet te melden dat de meikever schadelijk is. Nu, als dat zo is, dan is de huismus een nuttige vogelsoort! Volgens de Engelse wikipedia worden de meikever larven door mollen gegeten. ...

    29 April 2025

    De aankomst van een bijenvolk in mijn achtertuin


    Op zondag 27 april hoorde ik een enorm 'gezoem' in de achtertuin. Iemand in de buurt die een of ander elektrisch apparaat gebruikt? Nee. Het bleek een onvoorstelbaar grote wolk bijen te zijn die bij de vuurdoorn bleef rond dansen. 

    Ik moet zeggen dat de schrik er wel eventjes in zat. Je weet niet wat je overkomt. En of het gevaarlijk is. En wat ze van plan zijn. Wat doen ze daar? Ik heb toen mijn camera gegrepen om dit zeldzame natuurverschijnsel vast te leggen. Ze vormden een massieve kluit in de hoogste tak van de vuurdoorn. De vuurdoorn is 4 meter hoog. Waarom bij ons in de vuurdoorn?  Deze bloeit nog lang niet. De tuinen in de buurt bevatten geen of weinig groen. Dat kan een factor zijn. Dit zou een tijdelijke 'tussenstop' zijn van een bijenvolk op zoek naar een nieuwe locatie. Dat blijkt vaker voor te komen. Heb een imker gebeld maar die kwam niet op zondag. Na een paar uur waren ze weer vertrokken. Ik weet niet waar ze vandaan kwamen en waar ze naar toegingen. Ik schat het aantal op 500 tot 1000.



    Lukraak geschoten op de wolk bijen. Als je tientallen opnames maakt, zijn er door stom toeval wel een paar scherp. ObsIdentify heeft moeite met foto's van massa's door elkaar krioelende bijen, maar met een foto van een individuele bij komt hij toch op Honingbij Apis mellifera  (94%).

    Tot slot een variant op een oude Chinese wijsheid: 1 bij hoor je niet, maar duizend bijen maken een oorverdovend lawaai! Ra ra, hoe kan dat?

     

    Bronnen

    Op de website van de Bijenstichting vind je diverse mogelijkheden om de leefomstandigheden van enkele bedreigde wilde bijensoorten te verbeteren. Koop uitsluitend biologisch geteelde bloemenzaden (U snapt wel waarom).

    World Bee Day 20 mei 2025

    World Bee Day is wereldwijd uitgeroepen door de Verenigde Naties om aandacht te vragen voor het belang van bijen.

    26 April 2025

    Geelzwarte wespbij: is het een wesp of een bij? of allebij?

    Geelzwarte wespbij
    Nomada succincta
    Yellow legged Nomad Bee
    22 april 2025 ©Gert Korthof

    Op het eerste gezicht ziet dit insect er uit als een wesp. Maar het is een bij! Een wespbij. De natuur houdt zich niet aan onze indelingen. Maar waarom is het eigenlijk een bij? en geen wesp?

    Deze wespbij zat op een bloem van een Daslook. Gewoon langs een weg langs de bosrand. Gelukkig bleef hij eventjes stil zitten. En ook nog mooi horizontaal. Dat is erg handig, want zo is hij van voor tot achteren scherp. En de bloemen vormen een mooie witte achtergrond. De zon scheen. Het waaide even niet. Uit de hand gefotografeerd zonder statief. Perfect. Ik wou dat alle opnames zo scherp waren!

    Het blijkt dat deze wespbij geen 'normaal' leven te leiden. Deze wespbij is behoort tot het geslacht wespbijen (Nomada) en dat zijn nestparasieten of 'koekoeksbijen': ze maken niet zelf hun nest en verzamelen zelf geen stuifmeel, maar leggen hun eitje in het nest van een andere bij. Het is dus niet allemaal samenwerking (symbiose) in de natuur! Deze soort is niet de enige: het genus Nomada telt 49 soorten. Maar zoals op de foto te zien is: ze verzamelen kennelijk wel hun eigen voedsel. Wist ik allemaal niet.

    De identificatie door ObsIdentify (waarneming.nl) is 100% en is ondertussen goedgekeurd door een moderator. En: het is een vrouwtje geworden. Waarom is mij niet duidelijk. Het is kennelijk uit de foto af te leiden.

    Ter vergelijking: 


    Honingbij (80%) 22 april (©G.K.)

    Gewone wesp (92%) 20-08-2022 (©G.K.)


    Bronnen

    EIS Verspreidingsatlas Insecten

    Gedetailleerde uitleg verschillen wesp en wespbij

    Nederlands Soortenregister.

     

    Technische details

    Sony RX10-iv. t=1/8000 f/4,0 ISO 1000. Het is dus mogelijk om met ISO 1000 redelijk scherpe foto's te maken als de omstandigheden gunstig zijn. Een korte sluitertijd helpt natuurlijk altijd (in dit geval extreem kort). Ik vergroot de foto's nooit, ze worden alleen bijgesneden.

    21 April 2025

    Lonely Ring-necked Parakeet (Halsbandparkiet) on a rainy morning


    Eenzame Halsbandparkiet ( Psittacula krameri ) op
    een regenachtige ochtend in de krentenboom

    The Ring-necked Parakeet is originally a bird from Africa but has established itself in the wild in the Netherlands. It very likely depends for a large part of food (peanuts) provided by humans, especially in the winter. Although it can be found in towns and villages, it is still shy of people. They mostly can be seen in small groups.

    20 April 2025

    10 April 2025

    Big disappointment: KOBO ebook doesn't display figures and tables correctly

    The Evolution of Imperfection

    I have now 153 (non-fiction) e-books on my ten years old KOBO Auro HD reader. I never encountered problems with reading any of the books on it. A few days ago I bought Laurence D. Hurst (2025) 'The Evolution of Imperfection'. For the first time I discovered annoying problems with displaying content. In my e-reader a graph (Figure 6.1) is either displayed in an extremely small and consequently non readable size or is not displayed at all depending on the font size settings. 

    To check whether this fault is specific to the e-reader, I checked the display in the online KOBO browser application. Unexpectedly, Figure 6.1 in chapter 6 refused to show up with any font size or page setting. A large table, Table 6.1, is only visible and readable at specific settings, but is truncated at more comfortable bigger font sizes.


    Empty space where fig 6.1 should show up (browser)

    However, the graph is definitely present in the e-book:

    Display of the page in the e-book reader

    As can be seen in the above picture, although the graph is displayed, and the caption is readable, the graph itself is so small that labels cannot  be read. This makes the illustration useless. This is not the only illustration that gives troubles For example, Figure 2.1, 2.2, 4.1, 5.1, 5.2 and 6.2 are also absent in the browser or too small in the e-reader. This is very annoying. The problem is that the illustrations don't scale with font size. The font size can be huge while the illustration is still microscopic. 

    In a scientific book graphs and tables are essential. They are included for a good reason: they convey information. So, the book is kind of damaged and should not be sold in this condition. These errors make you think twice before buying a scientific e-book. The problem is of course that you don't know in advance.

    Has anybody experienced similar problems? For example with the Amazon Kindle e-reader or browser?

    The book is important for those interested in evolution, and I will blog about it as soon as I finished it.

     

    update 5 May: Figure 6.2 added.

    31 March 2025

    Zonsverduistering fotograferen met een gewone digitale camera? Het kan! (29 maart 2025) Solar eclipse with standard digital camera

    Solar eclipse 29 maart 2025 12:47 gedeeltelijke zonsverduistering
    SONY A6400 90mm f/8,0 t=1/3200 sec ISO=1000

    Niemand richt zijn camera op de zon. Je zou wel gek zijn. Maar het kan. Zonder je camera te beschadigen! Mijn eerste gedachte was: je moet de kortst mogelijke sluitertijd, het kleinste diafragma en de laagste lichtgevoeligheid (ISO) kiezen. Dat geeft de kortst mogelijke blootstelling aan het zonlicht. Onzin natuurlijk. Zelfs bij een gedeeltelijke zonsverduistering is het zonlicht veel te sterk en is het risico te groot dat de beeldsensor van de camera onherstelbaar beschadigd raakt. De beeldsensor is daar nu eenmaal niet voor gemaakt. Een zonsverduistering fotograferen is dus een veel grotere uitdaging dan een maansverduistering. Oplossing: een eclipsbril op de lens van de camera bevestigen.


    SONY α6400 met eclipsbril

    Met de eclipsbril voor de lens wordt het zoekerbeeld van de camera vreselijk donker. Dus het is even zoeken om de zon in het midden van het beeld te krijgen. Ik had de lichtgevoeligheid op ISO 1000 ingesteld om een korte belichting mogelijk te maken en met een diafragma van f/8,0 kwam ik op een sluitertijd van 1/3200 sec. Kort genoeg. De scherpstelling heb ik handmatig gedaan, visueel dus. Ondanks de eclipsbril ging het scherpstellen redelijk goed. De afstand is dan ongeveer oneindig ∞. Het resultaat is een redelijk scherp beeld. Het kan dus: een zonsverduistering fotograferen met een gewone digitale camera met een matige vergrotende telelens (90mm). De volgende keer (als ik de kans krijg!) gebruik ik een sterkere telelens in de hoop ook nog wat zonnevlekken te kunnen vastleggen...

    Het weer was wisselend bewolkt met voldoende onbewolkte momenten. Je moet dus een beetje geluk hebben. De meeste mensen hebben totaal niets van dit hemelse verschijnsel gemerkt. Het verschil tussen een gedeeltelijke zonsverduistering en een zon die gedeeltelijk door wisselende bewolking bedekt wordt, valt gewoon niet op. Maar ik moet zo'n zeldzame gebeurtenis gewoon fotograferen!


    Bronnen